28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0336 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 		 462 aa  899    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  62.34 
 
 		 497 aa  549  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  60.96 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  63.2 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  63.28 
 
 		 450 aa  509  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.03 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.28 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.07 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.29 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.56 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.78 
 
 		 460 aa  285  9e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.16 
 
 		 464 aa  275  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  34.19 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.35 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.17 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.64 
 
 		 444 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.17 
 
 		 459 aa  246  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.18 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.62 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.88 
 
 		 415 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.24 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.7 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.67 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.84 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  34.86 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.52 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.61 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.79 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>