28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1782 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 		 443 aa  887    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  34.91 
 
 		 412 aa  236  7e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.87 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.65 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.9 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.36 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.46 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  27.82 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.18 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  34.34 
 
 		 445 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.65 
 
 		 460 aa  183  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.08 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.92 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.52 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.99 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  24.14 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.29 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.71 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.31 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.32 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  28.92 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  26.59 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.63 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.48 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  26.46 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.88 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.06 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>