17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0193 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0193  transposase IS605 OrfB  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.822402 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0274  transposase, IS605 OrfB  83.95 
 
 
253 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.609151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1255  transposase, IS605 OrfB  81.07 
 
 
243 aa  427  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0682  transposase, IS605 OrfB  82.3 
 
 
243 aa  420  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0560477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
416 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  45.65 
 
 
417 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0134  IS605 family transposase OrfB  39.13 
 
 
403 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  51.35 
 
 
401 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  38.1 
 
 
433 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  44.68 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1067  IS605 family transposase OrfB  36.51 
 
 
416 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 
382 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  40.43 
 
 
443 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  40.43 
 
 
294 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  44.68 
 
 
485 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0427  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 
379 aa  42  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  42.55 
 
 
407 aa  42  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>