10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0682 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0682  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0560477 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0274  transposase, IS605 OrfB  83.13 
 
 
253 aa  426  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.609151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0193  transposase IS605 OrfB  82.3 
 
 
243 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.822402 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1255  transposase, IS605 OrfB  75.72 
 
 
243 aa  395  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0134  IS605 family transposase OrfB  36.76 
 
 
403 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  41.3 
 
 
416 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  43.48 
 
 
417 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  48.65 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  36.51 
 
 
433 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1067  IS605 family transposase OrfB  32.65 
 
 
416 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>