11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0274 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0274  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.609151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0193  transposase IS605 OrfB  83.95 
 
 
243 aa  436  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.822402 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0682  transposase, IS605 OrfB  83.13 
 
 
243 aa  426  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0560477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1255  transposase, IS605 OrfB  76.54 
 
 
243 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
416 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  45.65 
 
 
417 aa  45.8  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0134  IS605 family transposase OrfB  36.76 
 
 
403 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  38.1 
 
 
433 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1067  IS605 family transposase OrfB  36.51 
 
 
416 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  44.68 
 
 
159 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0427  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 
379 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>