34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2863 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  100 
 
 
312 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  82.79 
 
 
316 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  80.39 
 
 
315 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  78.83 
 
 
315 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  78.76 
 
 
315 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  80.87 
 
 
314 aa  517  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  78.18 
 
 
315 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  80.2 
 
 
314 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  80.54 
 
 
314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  78.1 
 
 
315 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  77.45 
 
 
316 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  77.24 
 
 
311 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  77.2 
 
 
308 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  74.59 
 
 
309 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  65.71 
 
 
312 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  66.13 
 
 
312 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  66.32 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  65.23 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  65.23 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  57.53 
 
 
318 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  52.44 
 
 
343 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  51.13 
 
 
325 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  48.93 
 
 
322 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  48.95 
 
 
335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  52.49 
 
 
335 aa  305  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  48.49 
 
 
317 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  51.5 
 
 
335 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  46.89 
 
 
308 aa  295  8e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  46.47 
 
 
340 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  32.8 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  33.14 
 
 
431 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.43 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>