34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59990 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  98.72 
 
 		 312 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  73.72 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  68.91 
 
 		 312 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  69.23 
 
 		 312 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  65.71 
 
 		 316 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  65.8 
 
 		 315 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  66.12 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  65.8 
 
 		 316 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  66.44 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  65.15 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  64.8 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  65.46 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  64.94 
 
 		 315 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  65.75 
 
 		 314 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  63.11 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  63.64 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  62.87 
 
 		 311 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  62.26 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  54.34 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  53.97 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  52.13 
 
 		 325 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  49.24 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  47.09 
 
 		 322 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  51.67 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  49.32 
 
 		 317 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  44.92 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  51 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  43.89 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.76 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  33.91 
 
 		 431 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.6 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.64 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.64 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>