34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4520 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  98.72 
 
 
312 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  73.72 
 
 
310 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  69.13 
 
 
312 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  68.91 
 
 
312 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  65.71 
 
 
316 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  65.8 
 
 
315 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  66.12 
 
 
315 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  65.8 
 
 
316 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  65.15 
 
 
315 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  66.44 
 
 
308 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  64.8 
 
 
314 aa  427  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  65.46 
 
 
314 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  64.94 
 
 
315 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  65.75 
 
 
314 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  63.06 
 
 
309 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  63.23 
 
 
315 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  62.87 
 
 
311 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  63.67 
 
 
312 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  55.08 
 
 
318 aa  359  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  53.23 
 
 
343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  52.13 
 
 
325 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  47.09 
 
 
322 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  50.64 
 
 
335 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  51.67 
 
 
335 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  49.32 
 
 
317 aa  292  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  44.92 
 
 
308 aa  289  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  51 
 
 
335 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  43.89 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  34.08 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  33.91 
 
 
431 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  27.66 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  27.34 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  27.34 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>