33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1059 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  681    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  69.5 
 
 
353 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  26.09 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  27.41 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  26.67 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  26.28 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  26.91 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  26.81 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  27.36 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  26.63 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  25.77 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  26.67 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  25.7 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  26.78 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  25.23 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  27.18 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  24.2 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  22.5 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  24.62 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  26.99 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  26.64 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  26.32 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  26.71 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  26.11 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  26.03 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  26.46 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  26.7 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  24.76 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  26.24 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  26.57 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>