34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1775 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  48.41 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  48.23 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  48.39 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  49 
 
 		 343 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  48.17 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  48.39 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  47.35 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  48.37 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  47.84 
 
 		 315 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  47.06 
 
 		 315 aa  308  9e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  47.18 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  47.57 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  46.91 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  47.18 
 
 		 315 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  48.16 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  47.3 
 
 		 314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  46.73 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  46.62 
 
 		 314 aa  299  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  50.99 
 
 		 335 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  50.66 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  50.66 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  46.28 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  46.89 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  47.1 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  48.29 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  46.43 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  46.43 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  40.51 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  32.04 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  37.04 
 
 		 431 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  25.82 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>