34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1621 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  100 
 
 
311 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  87.14 
 
 
308 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  77.6 
 
 
316 aa  524  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  79.08 
 
 
316 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  77.27 
 
 
315 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  79.19 
 
 
314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  79.53 
 
 
314 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  79.19 
 
 
314 aa  512  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  76.95 
 
 
315 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  75.97 
 
 
315 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  77.24 
 
 
312 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  75.4 
 
 
315 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  75.9 
 
 
315 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  69.93 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  64.36 
 
 
312 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  63.67 
 
 
312 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  65.15 
 
 
310 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  64.41 
 
 
312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  64.41 
 
 
312 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  55.84 
 
 
318 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  52.58 
 
 
343 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  51.61 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  48.47 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  50.62 
 
 
335 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  50.46 
 
 
335 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  48.39 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  50.77 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  49.66 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  45.69 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  35.08 
 
 
431 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  25.89 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>