31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2753 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  887    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  40.1 
 
 
340 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  36.36 
 
 
318 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  35.8 
 
 
343 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  35.23 
 
 
325 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  37.04 
 
 
308 aa  106  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  36.36 
 
 
315 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  32.8 
 
 
316 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  36.84 
 
 
322 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  37.43 
 
 
335 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  38.3 
 
 
335 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  35.8 
 
 
315 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  35.08 
 
 
311 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  35.5 
 
 
308 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  37.43 
 
 
335 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  34.09 
 
 
315 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  33.84 
 
 
317 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  34.66 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  35.23 
 
 
315 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  34.91 
 
 
310 aa  97.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  33.14 
 
 
312 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  33.52 
 
 
316 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  33.91 
 
 
312 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  33.91 
 
 
312 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  34.32 
 
 
312 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  34.32 
 
 
312 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  30.8 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  33.14 
 
 
314 aa  90.5  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  33.14 
 
 
314 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  32.57 
 
 
314 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>