34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3331 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  95.08 
 
 		 343 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  68 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  55.52 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  54.22 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  56.17 
 
 		 312 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  53.95 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  57.84 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  53.59 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  53.75 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  52.94 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  52.94 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  55 
 
 		 312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  53.27 
 
 		 316 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  55 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  52.7 
 
 		 314 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  52.44 
 
 		 315 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  52.94 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  52.03 
 
 		 314 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  51.13 
 
 		 312 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  51.61 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  51.35 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  49.22 
 
 		 322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  50.15 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  52.12 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  48.16 
 
 		 308 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  52.12 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  49.83 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  40.76 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  35.23 
 
 		 431 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.71 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.71 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>