34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1394 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  93.95 
 
 
315 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  91.11 
 
 
315 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  90.45 
 
 
315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  89.81 
 
 
315 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  90.71 
 
 
316 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  81.7 
 
 
316 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  78.18 
 
 
312 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  81.54 
 
 
314 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  81.21 
 
 
314 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  80.87 
 
 
314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  75.4 
 
 
311 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  74.35 
 
 
308 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  75.49 
 
 
309 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  67.74 
 
 
312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  67.64 
 
 
310 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  65.81 
 
 
312 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  66.9 
 
 
312 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  66.9 
 
 
312 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  55.88 
 
 
318 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  52.44 
 
 
343 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  52.44 
 
 
325 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  47.19 
 
 
322 aa  308  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  46.91 
 
 
308 aa  306  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  48.01 
 
 
335 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  48.16 
 
 
335 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  47.08 
 
 
317 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  47.85 
 
 
335 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  45.67 
 
 
340 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.12 
 
 
384 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  36.36 
 
 
431 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.25 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.25 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.76 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>