34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0490 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  79.15 
 
 
316 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  76.14 
 
 
315 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  77.12 
 
 
315 aa  504  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  75.97 
 
 
315 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  76.47 
 
 
315 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  75.49 
 
 
316 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  75.49 
 
 
315 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  78.45 
 
 
314 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  78.11 
 
 
314 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  74.59 
 
 
312 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  76.77 
 
 
314 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  69.93 
 
 
311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  69.58 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  68.28 
 
 
310 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  66.56 
 
 
312 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  66.56 
 
 
312 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  66.43 
 
 
312 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  66.43 
 
 
312 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  53.9 
 
 
343 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  55.08 
 
 
318 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  53.75 
 
 
325 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  48.94 
 
 
322 aa  309  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  50.31 
 
 
335 aa  305  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  51.67 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  46.73 
 
 
308 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  51.33 
 
 
335 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  48.29 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  42.18 
 
 
340 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  35.2 
 
 
384 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.6 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.46 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.46 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>