34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4074 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  94.63 
 
 
335 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  94.33 
 
 
335 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  69.4 
 
 
322 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  67.01 
 
 
317 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  52.6 
 
 
318 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  50.77 
 
 
311 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  51.85 
 
 
310 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  52.06 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  51.91 
 
 
312 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  52.82 
 
 
343 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  50.64 
 
 
314 aa  315  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  53.49 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  49.06 
 
 
308 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  50.82 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  50.16 
 
 
312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  49.36 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  51.66 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  50.8 
 
 
309 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  48.47 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  46.63 
 
 
316 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  48.16 
 
 
315 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  50 
 
 
315 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  50.63 
 
 
315 aa  299  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  49.68 
 
 
315 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  50.68 
 
 
312 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  50.68 
 
 
312 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  40.77 
 
 
340 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.77 
 
 
384 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  38.3 
 
 
431 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  24.48 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  24.75 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  24.75 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>