34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0651 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  43.4 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  45.83 
 
 
316 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  46.47 
 
 
312 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  45.67 
 
 
315 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  42.86 
 
 
315 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  43.25 
 
 
316 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  44.79 
 
 
314 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  41.94 
 
 
315 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  45.18 
 
 
315 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  44.48 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  44.17 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  45.69 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  41.52 
 
 
308 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  42.18 
 
 
309 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  40.51 
 
 
308 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  45.16 
 
 
318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  43.07 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  43.08 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  45.67 
 
 
312 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  45.67 
 
 
312 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  42.9 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  42.68 
 
 
343 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  40.76 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  41.38 
 
 
335 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  40.81 
 
 
312 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  42.68 
 
 
335 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  41.25 
 
 
317 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  35.56 
 
 
384 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  40.1 
 
 
431 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  27.18 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  27.18 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.83 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>