34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0679 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  100 
 
 
322 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  74.84 
 
 
317 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  73.06 
 
 
335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  69.09 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  72.73 
 
 
335 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  51.84 
 
 
318 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  49.53 
 
 
343 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  51.53 
 
 
312 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  49.22 
 
 
325 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  50.15 
 
 
312 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  48.47 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  49.69 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  49.84 
 
 
314 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  48.93 
 
 
312 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  48.41 
 
 
308 aa  316  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  48.75 
 
 
315 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  48.6 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  49.53 
 
 
314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  49.53 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  48.12 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  48.31 
 
 
315 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  48.94 
 
 
309 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  47.19 
 
 
315 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  47.98 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  47.98 
 
 
315 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  49.16 
 
 
312 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  45.74 
 
 
310 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  49.16 
 
 
312 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  42.9 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  34.38 
 
 
384 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  36.84 
 
 
431 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  25.7 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  25.7 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  25.27 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>