38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2087 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  35.96 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  37.61 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  37.61 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  36.61 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  36.52 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  31.36 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  31.97 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  32.52 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  33.94 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1120  hypothetical protein  32.76 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1399  hypothetical protein  32.76 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2253  transmembrane protein  30.97 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  30.28 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  26.27 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  37.17 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2419  hypothetical protein  27.43 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.442896  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5262  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.307467  normal  0.795438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  23.68 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3636  putative transmembrane protein  25.66 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0384359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  27.68 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  26.13 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  28.32 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0332  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  30.68 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0927  putative transmembrane protein  25 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.57023  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  23.28 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0366  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3268  putative transmembrane protein  31.4 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.499549  normal  0.0361072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2621  putative transmembrane protein  30.58 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  25.22 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1062  hypothetical protein  24.55 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948035  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  25.64 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  25.64 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  24.58 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1195  putative transmembrane protein  25.64 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433545  decreased coverage  0.00478766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1742  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0167409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0992  hypothetical protein  25.83 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225533  normal  0.0698577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>