18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4218 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  91.2 
 
 		 125 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  53.6 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  52.8 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  54.4 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  29.73 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  28.79 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  23.28 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  22.22 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  25.22 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  27.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  25.22 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  26.09 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  22.58 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  21.77 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  25.86 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>