29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2459 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  36.61 
 
 
131 aa  87  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  34.51 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  33.9 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  32.46 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  30.09 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  30.09 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  34.55 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  30.97 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  28.79 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  28.03 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  29.2 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  28.03 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  30.58 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  24 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  27.42 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  27.42 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  25 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1443  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.969465  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1374  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  28.03 
 
 
125 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  25 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1120  hypothetical protein  29.91 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1399  hypothetical protein  29.91 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  27.5 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  32.69 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3268  putative transmembrane protein  27.5 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.499549  normal  0.0361072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5262  putative transmembrane protein  24.56 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.307467  normal  0.795438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>