20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1474 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  257  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  72.8 
 
 		 125 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  71.2 
 
 		 125 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  54.4 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  55.2 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  26.72 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  27.43 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  27.43 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  30.97 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  26.13 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  25.64 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  24 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  22.81 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  27.5 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  23.28 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1399  hypothetical protein  28.06 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1120  hypothetical protein  28.06 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  26.96 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>