17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1389 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  256  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  28.69 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  28.23 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  29.03 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  25.78 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  26.23 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  31.09 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  30.58 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  25 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  28.95 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  26.55 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  22.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  24.58 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  22.5 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  23.33 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>