26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0649 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  66.37 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3636  putative transmembrane protein  47.32 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0384359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1401  putative transmembrane protein  48.78 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3268  putative transmembrane protein  47.75 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.499549  normal  0.0361072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2621  putative transmembrane protein  46.09 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3062  putative transmembrane protein  49.11 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.283564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1195  putative transmembrane protein  41.27 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433545  decreased coverage  0.00478766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5262  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.307467  normal  0.795438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1742  putative transmembrane protein  40.68 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0167409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  36.52 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2419  hypothetical protein  43.64 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.442896  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  38.94 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0927  putative transmembrane protein  39.82 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.57023  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  33.93 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1062  hypothetical protein  35.51 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948035  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0992  hypothetical protein  41.59 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225533  normal  0.0698577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2253  transmembrane protein  36.21 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  26.27 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  30.77 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  25.45 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1120  hypothetical protein  25.42 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1399  hypothetical protein  25.42 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  22.41 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  22.41 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  25.49 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>