25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1742 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1742  putative transmembrane protein  100 
 
 		 116 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0167409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3636  putative transmembrane protein  66.37 
 
 		 113 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0384359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3062  putative transmembrane protein  65.49 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.283564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5262  putative transmembrane protein  59.26 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.307467  normal  0.795438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1401  putative transmembrane protein  56.76 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3268  putative transmembrane protein  53.7 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.499549  normal  0.0361072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2621  putative transmembrane protein  52.78 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1195  putative transmembrane protein  58.33 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433545  decreased coverage  0.00478766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  41.44 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  40.68 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  43.48 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0927  putative transmembrane protein  41.38 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.57023  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1062  hypothetical protein  39.42 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948035  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0992  hypothetical protein  43.53 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225533  normal  0.0698577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  36.73 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2419  hypothetical protein  35.45 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.442896  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  34.82 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2253  transmembrane protein  31.25 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  31.86 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  30.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  27.45 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  29.41 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  28.43 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>