30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2313 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  233  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  36.52 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2621  putative transmembrane protein  37.72 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5262  putative transmembrane protein  38.05 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.307467  normal  0.795438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  36.52 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3268  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.499549  normal  0.0361072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  33.05 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3636  putative transmembrane protein  32 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0384359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1195  putative transmembrane protein  36.54 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433545  decreased coverage  0.00478766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1401  putative transmembrane protein  36.54 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0927  putative transmembrane protein  35.45 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.57023  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  34.78 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  33.67 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3062  putative transmembrane protein  34.95 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.283564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0992  hypothetical protein  33.03 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225533  normal  0.0698577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1742  putative transmembrane protein  36.73 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0167409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  25.23 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1062  hypothetical protein  28.85 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948035  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2253  transmembrane protein  28.18 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  26.42 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2419  hypothetical protein  31.78 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.442896  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  22.81 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  27.35 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  29.27 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  25.86 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  29.27 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>