25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1091 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  35.9 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  33.03 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  33.94 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  26.72 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  33.05 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  29.31 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  32.43 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  29.31 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  32.61 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  25.23 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  25.45 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1374  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1443  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.969465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  25.42 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  24.59 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  23.89 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  22.22 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  23.89 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  23.77 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  23.4 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  22.22 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3636  putative transmembrane protein  21.51 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0384359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  23.42 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>