33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1006 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  37.61 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  37.19 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2253  transmembrane protein  35.04 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2419  hypothetical protein  32.48 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.442896  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  27.43 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  29.82 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  34.19 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  29.41 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5262  putative transmembrane protein  39.24 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.307467  normal  0.795438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  25.64 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0927  putative transmembrane protein  25.22 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.57023  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3239  putative transmembrane protein  28.21 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.0295359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1062  hypothetical protein  30.28 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948035  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  25.23 
 
 
125 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3636  putative transmembrane protein  30.51 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0384359  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  31.71 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  25.83 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  21.74 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  23.89 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0992  hypothetical protein  25.26 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225533  normal  0.0698577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1401  putative transmembrane protein  28.07 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  25.23 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3268  putative transmembrane protein  28.95 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.499549  normal  0.0361072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0599  hypothetical protein  21.37 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000903433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  22.41 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2621  putative transmembrane protein  28.7 
 
 
125 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>