14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2244 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  36.59 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  28.69 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  29.2 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  25.44 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  30.36 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  25.83 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  25.83 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  24.14 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  27.59 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0366  hypothetical protein  28.33 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  27.19 
 
 
125 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>