20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1346 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  28.81 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  31.97 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  30.97 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  29.73 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  28.95 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  28.07 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  33.05 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  31.36 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  25.64 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  25.64 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  28.46 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  26.23 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  25.44 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  27.78 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  22.69 
 
 
130 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  21.85 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3952  hypothetical protein  26.13 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>