25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2976 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  71.9 
 
 
125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1374  hypothetical protein  47.01 
 
 
125 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1443  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.969465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  35.96 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  37.19 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  37.19 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  35.63 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  28.81 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  35.45 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  29.75 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  29.75 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  26.23 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  30.36 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  27.73 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  25.64 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  26.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  28.95 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  25.22 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0649  hypothetical protein  25.49 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0324025  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1991  hypothetical protein  29.51 
 
 
444 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  0.0451429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0366  hypothetical protein  23.97 
 
 
131 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0244994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>