21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01716 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  255  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  71.9 
 
 
127 aa  190  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1374  hypothetical protein  44.8 
 
 
125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1443  hypothetical protein  44 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.969465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  31.36 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  34.19 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  34.19 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  30.09 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  31.36 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  32.43 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  31.97 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  29.17 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  28.7 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  27.83 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  24.27 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  26.55 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  27.19 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  23.89 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  23.93 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>