More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0481 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0481  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1672  GTP cyclohydrolase I  75.24 
 
 		 217 aa  321  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2146  GTP cyclohydrolase I  72.43 
 
 		 210 aa  287  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0727  GTP cyclohydrolase I  72.43 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.275791  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1761  GTP cyclohydrolase I  74.33 
 
 		 210 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0248  GTP cyclohydrolase I  73.8 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1698  GTP cyclohydrolase I  72.43 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0552  GTP cyclohydrolase I  72.43 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11912  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0090  GTP cyclohydrolase I  74.59 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.459759  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0331  GTP cyclohydrolase I  74.59 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0163872  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1258  GTP cyclohydrolase I  74.59 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1673  GTP cyclohydrolase I  74.59 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1092  GTP cyclohydrolase I  74.03 
 
 		 210 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1387  GTP cyclohydrolase I  64.08 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2050  putative GTP cyclohydrolase I  73.85 
 
 		 131 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0626  GTP cyclohydrolase I  73.85 
 
 		 131 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1888  GTP cyclohydrolase I  48.94 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391587  normal  0.100601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1913  GTP cyclohydrolase I  42.04 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  38.04 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1998  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 226 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1965  GTP cyclohydrolase I  42.21 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  37.57 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  38.67 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  38.62 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  37.89 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  41.01 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  40.29 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  34.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  38.1 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  38.1 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  37.16 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  32.98 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  32.98 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  40.62 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  34.39 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  36.46 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  36.27 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  38.13 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  35.16 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  35.64 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  32.45 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  32.6 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  34.81 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  33.15 
 
 		 187 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  34.21 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  40.62 
 
 		 186 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  37.76 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  34.21 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  37.76 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  37.3 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  32.26 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  36.88 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  34.27 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  37.68 
 
 		 181 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  39.76 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  34.36 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  31.38 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  36.96 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  31.94 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  38.28 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  38.51 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  39.52 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  35.29 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  31.64 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  37.01 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  37.36 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  32.82 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  37.65 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  35.26 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  36.17 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  31.72 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  36.9 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  35.44 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  36.76 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  35.33 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1879  GTP cyclohydrolase I  28.8 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000201387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  33.9 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  37.76 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  36.7 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  36.76 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  31.72 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  37.06 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  37.8 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  34.87 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  37.87 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  36.96 
 
 		 181 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  34.41 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  34.48 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  37.01 
 
 		 181 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  30.14 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  31.46 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>