More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1387 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1387  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0331  GTP cyclohydrolase I  84.66 
 
 		 210 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0163872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1673  GTP cyclohydrolase I  84.66 
 
 		 210 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0090  GTP cyclohydrolase I  84.66 
 
 		 210 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.459759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1258  GTP cyclohydrolase I  84.66 
 
 		 210 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238409  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1092  GTP cyclohydrolase I  84.66 
 
 		 210 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2146  GTP cyclohydrolase I  83.68 
 
 		 210 aa  331  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0727  GTP cyclohydrolase I  83.68 
 
 		 210 aa  330  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.275791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1698  GTP cyclohydrolase I  83.68 
 
 		 227 aa  330  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0552  GTP cyclohydrolase I  83.68 
 
 		 227 aa  330  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0248  GTP cyclohydrolase I  83.6 
 
 		 210 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1761  GTP cyclohydrolase I  83.6 
 
 		 210 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1672  GTP cyclohydrolase I  70.87 
 
 		 217 aa  294  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0481  GTP cyclohydrolase I  64.08 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2050  putative GTP cyclohydrolase I  87.6 
 
 		 131 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0626  GTP cyclohydrolase I  87.6 
 
 		 131 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1888  GTP cyclohydrolase I  48.68 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391587  normal  0.100601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1913  GTP cyclohydrolase I  45.81 
 
 		 226 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1998  GTP cyclohydrolase I  45.81 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1965  GTP cyclohydrolase I  39.09 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  37.1 
 
 		 189 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  36.22 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  37.04 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  34.15 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  39.04 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  32.85 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  35.56 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  34.98 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  32.85 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  35.83 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  36.72 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  34.22 
 
 		 199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  38.78 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  35.59 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  38.78 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  36.76 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  33.89 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  33.7 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  31.35 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  35.29 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  36.3 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  32.79 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  32.79 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  34.97 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  34.04 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  35.79 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  34.73 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  35.83 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  34.22 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  36.22 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  32.7 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  32.98 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  33.65 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  37.58 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  36.36 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  32.7 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  34.66 
 
 		 223 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  35.42 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  36.36 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  34.92 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  34.92 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  34.92 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  33.51 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  31.72 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  33.66 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  36.27 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  32.24 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 189 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  37.4 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  32.39 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  32.97 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  33.69 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  32.07 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  37.41 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  35.03 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  37.4 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  35.85 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  34.05 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  35.62 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  35.17 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  35.67 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  37.36 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  32.28 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  31.89 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  37.4 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  31.69 
 
 		 190 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  35.83 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>