More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0626 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2146  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
210 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11266  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0626  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2050  putative GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0727  GTP cyclohydrolase I  99.24 
 
 
210 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.275791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0552  GTP cyclohydrolase I  99.24 
 
 
227 aa  270  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1698  GTP cyclohydrolase I  99.24 
 
 
227 aa  270  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0248  GTP cyclohydrolase I  89.23 
 
 
210 aa  245  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1761  GTP cyclohydrolase I  89.23 
 
 
210 aa  245  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1258  GTP cyclohydrolase I  89.23 
 
 
210 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238409  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0090  GTP cyclohydrolase I  89.23 
 
 
210 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.459759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1673  GTP cyclohydrolase I  89.23 
 
 
210 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0331  GTP cyclohydrolase I  89.23 
 
 
210 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0163872  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1092  GTP cyclohydrolase I  88.46 
 
 
210 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1387  GTP cyclohydrolase I  87.6 
 
 
209 aa  239  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172652  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1672  GTP cyclohydrolase I  76.74 
 
 
217 aa  213  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0481  GTP cyclohydrolase I  73.85 
 
 
215 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1888  GTP cyclohydrolase I  51.2 
 
 
219 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391587  normal  0.100601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1913  GTP cyclohydrolase I  47.54 
 
 
226 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1998  GTP cyclohydrolase I  46.72 
 
 
226 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  38.76 
 
 
186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  38.28 
 
 
181 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  37.98 
 
 
213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  38.28 
 
 
181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1965  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  37.21 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  37.21 
 
 
184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  38.28 
 
 
181 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  39.37 
 
 
185 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  37.01 
 
 
181 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  37.01 
 
 
181 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  37.98 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  40.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 
189 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  38.76 
 
 
185 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 
181 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  40.16 
 
 
179 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  37.98 
 
 
186 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  40.16 
 
 
190 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  37.21 
 
 
186 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  35.43 
 
 
181 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  37.5 
 
 
181 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  37.98 
 
 
187 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  37.01 
 
 
184 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  37.21 
 
 
187 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
203 aa  103  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  36.43 
 
 
186 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  36.43 
 
 
186 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  35.43 
 
 
201 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  37.21 
 
 
186 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  36.43 
 
 
188 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1275  GTP cyclohydrolase  38.28 
 
 
349 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  34.11 
 
 
195 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 
190 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  36.43 
 
 
270 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 
190 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  36.72 
 
 
179 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 
190 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  39.34 
 
 
213 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  39.34 
 
 
213 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  38.46 
 
 
206 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  32.56 
 
 
203 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  37.01 
 
 
219 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  36.72 
 
 
188 aa  100  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  37.8 
 
 
219 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  36.22 
 
 
198 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  37.59 
 
 
189 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  38.17 
 
 
219 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  38.17 
 
 
193 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  33.59 
 
 
199 aa  99.4  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  38.93 
 
 
202 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  39.69 
 
 
202 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  37.98 
 
 
214 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  35.16 
 
 
190 aa  99.8  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  38.46 
 
 
209 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  37.88 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  35.43 
 
 
235 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  38.17 
 
 
205 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  39.85 
 
 
226 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  37.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  35.66 
 
 
223 aa  98.2  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  35.94 
 
 
202 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  33.33 
 
 
184 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  34.65 
 
 
226 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  40.16 
 
 
206 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  36.22 
 
 
235 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  38.71 
 
 
200 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  34.65 
 
 
223 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 
189 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  38.46 
 
 
219 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  35.16 
 
 
218 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>