More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1998 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1998  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 226 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1913  GTP cyclohydrolase I  98.67 
 
 		 226 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1965  GTP cyclohydrolase I  98.5 
 
 		 228 aa  357  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1888  GTP cyclohydrolase I  71.08 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391587  normal  0.100601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1672  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2146  GTP cyclohydrolase I  41.67 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0727  GTP cyclohydrolase I  41.67 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.275791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0552  GTP cyclohydrolase I  42.71 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1698  GTP cyclohydrolase I  42.71 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0090  GTP cyclohydrolase I  42.19 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.459759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1258  GTP cyclohydrolase I  42.19 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238409  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0331  GTP cyclohydrolase I  42.19 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0163872  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1092  GTP cyclohydrolase I  42.19 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1761  GTP cyclohydrolase I  42.47 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1673  GTP cyclohydrolase I  42.19 
 
 		 210 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0248  GTP cyclohydrolase I  42.47 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1387  GTP cyclohydrolase I  42.13 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  36.36 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0481  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  35.33 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  37.35 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  37.35 
 
 		 190 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  37.35 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  37.42 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  37.11 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  36.97 
 
 		 194 aa  122  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  36.14 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  34.34 
 
 		 179 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  36.56 
 
 		 189 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  38.51 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0626  GTP cyclohydrolase I  46.72 
 
 		 131 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2050  putative GTP cyclohydrolase I  46.72 
 
 		 131 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  36.48 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  36.41 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  36.41 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  34.59 
 
 		 180 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  35.8 
 
 		 187 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  41.57 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  41.11 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  32.83 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  32.42 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  37.02 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  37.04 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  37.71 
 
 		 201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  35.36 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  34.86 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  34.97 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  41.62 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  38.27 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  32.99 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  36.48 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  45.03 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  36.9 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  37.11 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  34.78 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  33.69 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  35.79 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  33.67 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  36.27 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  39.02 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  36.41 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  35 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  39.56 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  33.69 
 
 		 186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  33.51 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  33.51 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  33.75 
 
 		 189 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  37.66 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  38.86 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  37.43 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  39.01 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  40.11 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  37.14 
 
 		 189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  35.9 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  41.78 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  37.04 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  39.32 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  41.78 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  37.43 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  34.22 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  34.09 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  39.34 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  34.22 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  36.42 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  34.64 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  34.81 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  35.38 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  36.92 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>