More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1275 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1275  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 349 aa  711    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1278  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00712716  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  51.87 
 
 		 195 aa  193  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  51.7 
 
 		 202 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  51.7 
 
 		 190 aa  188  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 219 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 188 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  47.64 
 
 		 213 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.89 
 
 		 188 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  51.1 
 
 		 190 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  47.12 
 
 		 213 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 190 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 192 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 179 aa  185  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  50.57 
 
 		 190 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 190 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 224 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  48.31 
 
 		 189 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  49.16 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 189 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 188 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  50.85 
 
 		 218 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 		 188 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 186 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 189 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 187 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 		 223 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  48.13 
 
 		 194 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 190 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 		 186 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  49.14 
 
 		 186 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 210 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 		 226 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 207 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 		 181 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 		 194 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 187 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  48.04 
 
 		 185 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 187 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  49.16 
 
 		 181 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  48.94 
 
 		 213 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  48.74 
 
 		 235 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 223 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  51.15 
 
 		 210 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  49.72 
 
 		 219 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 187 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  47.49 
 
 		 181 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 193 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 		 187 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 		 186 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  43.56 
 
 		 202 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 202 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  44.06 
 
 		 269 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 198 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  44.06 
 
 		 269 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 		 187 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 202 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  48 
 
 		 186 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  45.99 
 
 		 219 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  49.15 
 
 		 185 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 213 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 222 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  47.49 
 
 		 181 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 188 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 219 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  43.72 
 
 		 226 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 		 216 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  48.7 
 
 		 239 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  47.89 
 
 		 247 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  44.39 
 
 		 225 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  48.33 
 
 		 185 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  48.7 
 
 		 239 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 181 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  49.48 
 
 		 193 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  43.56 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 181 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  47.13 
 
 		 184 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  52.3 
 
 		 185 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  46.81 
 
 		 214 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 		 219 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  46.81 
 
 		 214 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  52.3 
 
 		 185 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  46.93 
 
 		 186 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 206 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 199 aa  173  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 181 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 213 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>