More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1536 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1536  membrane protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0548  membrane protein  74.62 
 
 
215 aa  313  9e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000184077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0338  membrane protein  57.71 
 
 
200 aa  229  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0336  membrane protein  50 
 
 
199 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0166  membrane protein  40.1 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  40 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  31.22 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  31.79 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  29.95 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  37.01 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  30.41 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2184  protein of unknown function DUF205  43.27 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0014182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  34.96 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  37.01 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  28.11 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0662  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.1 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1072  hypothetical protein  35.82 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.205087  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.52 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.35 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  40.59 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  37.17 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  30.24 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  28.93 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  30.24 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  33.6 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  29.81 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  29.06 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  31.54 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  26.6 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.13 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1893  hypothetical protein  36.75 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.570365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  27.54 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17280  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.48 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  29.2 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  27.62 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  32.73 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.05 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3809  hypothetical protein  32.43 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.91 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  30.69 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03451  membrane protein  36.04 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.04 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  33.33 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  25.82 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  33.04 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.17 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  25 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  35.19 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  30.32 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.37 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  36.04 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  27.84 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2991  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.12 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.701481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.44 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  32.82 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  34.31 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1187  protein of unknown function DUF205  34.78 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000281015  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  32.82 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  33.33 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  28.8 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.23 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.05 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.37 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.05 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.04 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  34.4 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.36 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.05 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.3 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  34.4 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.09 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.09 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2284  protein of unknown function DUF205  34.48 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3393  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000138608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3397  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0827634  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf866  hypothetical protein  37.07 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3467  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.088969  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.88 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.09 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3237  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.400213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3563  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.299047  normal  0.098829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.03 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  28.32 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3461  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0949629  normal  0.0662148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.2 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.09 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.05 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.09 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>