155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1940 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  65.83 
 
 		 200 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  65.83 
 
 		 200 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  67.34 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  57.69 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  50.75 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  53.88 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  38.16 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  35.89 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  37.68 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  38.43 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  35.79 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  35.96 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  36.41 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  36.59 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  34.12 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  33.83 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  36.71 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  36.71 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  30.43 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  32.69 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  35.82 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  30.49 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  36.27 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  37.75 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  36.79 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  35.96 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  35.96 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  35.96 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  32.72 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  33.99 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  36.11 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  36.87 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  28.91 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  35.32 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  34.39 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  29.23 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  34.91 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  34.91 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  32.93 
 
 		 181 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  34.91 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  32.81 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  32.34 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  32.93 
 
 		 181 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  32.34 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  32.34 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  32.34 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  34.36 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  33.53 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  30.37 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  31.55 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  32.66 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  32.29 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  32.14 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  32.99 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  32.34 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  27.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  28.93 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  26.94 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  29.94 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  31.74 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  28.65 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  30.34 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  32.04 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  33.53 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  32.4 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  32.4 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  30.64 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  30.64 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  30.64 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  30.64 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0875  intracellular septation protein A  34.68 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.794525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3790  intracellular septation protein A  31.38 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000185516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  32.95 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  27.87 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  30.64 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  28.65 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1878  intracellular septation protein A  36.03 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  32.37 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  32.4 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  29.78 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2029  intracellular septation protein A  34.56 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1675  intracellular septation protein A  34.56 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  32.53 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4007  intracellular septation protein A  29.89 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  30.34 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1840  intracellular septation protein A  30.26 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  27.53 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2260  intracellular septation protein A  32.34 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000102415  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4501  intracellular septation protein A  29.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2903  intracellular septation protein A  28.71 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130707  normal  0.228899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>