156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3143 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  100 
 
 
233 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  61.86 
 
 
218 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  47.06 
 
 
220 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  45.79 
 
 
200 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  45.25 
 
 
220 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  44.13 
 
 
205 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  47.14 
 
 
210 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  42.92 
 
 
220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  42.92 
 
 
220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  42.18 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  45.73 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  43.2 
 
 
206 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  43.9 
 
 
206 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  43.9 
 
 
206 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  45.19 
 
 
195 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  45.93 
 
 
204 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  44.39 
 
 
214 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  44.66 
 
 
203 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  44.5 
 
 
206 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  43.69 
 
 
214 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  43.72 
 
 
210 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  43.13 
 
 
199 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  36.24 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  42.13 
 
 
190 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  45.15 
 
 
216 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  46.23 
 
 
205 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  33.19 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  37.2 
 
 
221 aa  118  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  34.95 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  35.59 
 
 
209 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  30.49 
 
 
211 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  36.19 
 
 
229 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  33.48 
 
 
219 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  34.1 
 
 
222 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  34.09 
 
 
215 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  33.17 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4859  intracellular septation protein A  30.08 
 
 
221 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.254095  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  33.33 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  37.25 
 
 
181 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  32.72 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  36.46 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  32.08 
 
 
181 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  36.46 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  36.46 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  33.12 
 
 
183 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  33.97 
 
 
181 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  31.53 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  31.53 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  36.97 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  34 
 
 
181 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
183 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  35.19 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  30.23 
 
 
182 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  36.07 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  36.07 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  35.76 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  32.51 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2937  intracellular septation protein A  35.23 
 
 
179 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  31.55 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  33.9 
 
 
194 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  37.5 
 
 
179 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  35.62 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  34.78 
 
 
179 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  33.14 
 
 
189 aa  85.5  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  33.14 
 
 
189 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
181 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
181 aa  85.1  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  31.82 
 
 
181 aa  85.1  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
179 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  35 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  35 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  35 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  35 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  34.15 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  34.39 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  33.53 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1834  intracellular septation protein A  31.34 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  31.85 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2260  intracellular septation protein A  32.48 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000102415  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  31.85 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  31.85 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  31.85 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  35 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2018  Intracellular septation protein A  32.54 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0839964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2583  intracellular septation protein A  31.9 
 
 
193 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  30.3 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  34 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1802  intracellular septation protein A  35.98 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  36.6 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0875  intracellular septation protein A  35 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.794525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>