156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0363 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  100 
 
 
205 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  90.69 
 
 
210 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  80.81 
 
 
200 aa  328  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  81.12 
 
 
200 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  87.32 
 
 
205 aa  317  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  80 
 
 
206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  78.17 
 
 
199 aa  298  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  50 
 
 
214 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  54.59 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  52.63 
 
 
220 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  53.47 
 
 
203 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  51.02 
 
 
210 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  48.8 
 
 
220 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  50.52 
 
 
214 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  56.61 
 
 
206 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  54.36 
 
 
203 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  55.56 
 
 
206 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  55.56 
 
 
206 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  54.11 
 
 
216 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  49.74 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  44.6 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  49.29 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  49.29 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  43.81 
 
 
211 aa  171  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  44.13 
 
 
233 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  49.47 
 
 
190 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  42.93 
 
 
208 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  38.68 
 
 
221 aa  131  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  35.96 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  45.79 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  39.53 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  38.5 
 
 
209 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  38.37 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  38.46 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  32.52 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  38.66 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  38.66 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  37.7 
 
 
189 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  37.17 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  41.72 
 
 
181 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
180 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
180 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
180 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  37.85 
 
 
186 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  42.58 
 
 
179 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  42.58 
 
 
179 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  42.58 
 
 
179 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  34.69 
 
 
222 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  42.58 
 
 
179 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
203 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
203 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
203 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
181 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  34.04 
 
 
214 aa  104  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  35.67 
 
 
181 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  36.36 
 
 
183 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  35.76 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  35.42 
 
 
219 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  34.3 
 
 
181 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  35.09 
 
 
181 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  37.02 
 
 
187 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  40 
 
 
179 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  35.67 
 
 
197 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  41.94 
 
 
179 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  37.16 
 
 
190 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  35.16 
 
 
188 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
181 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
181 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  34.87 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  33.72 
 
 
181 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
199 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  36.9 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  31.67 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  35.76 
 
 
183 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  37.5 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  38.71 
 
 
179 aa  98.2  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  37.77 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  37.77 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  33.33 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  38.71 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  34.62 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  34.44 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  36.51 
 
 
186 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  33.33 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  33.85 
 
 
189 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0875  intracellular septation protein A  34.87 
 
 
153 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.794525  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  36.26 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6169  intracellular septation protein A  36.99 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  36.99 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>