159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4299 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  55.05 
 
 
211 aa  234  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  58.59 
 
 
200 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  57.07 
 
 
200 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  57.07 
 
 
200 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  49.76 
 
 
209 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  48.96 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  38.97 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  37.62 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  35.07 
 
 
220 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  35.89 
 
 
220 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  36.08 
 
 
200 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  37.97 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  37.43 
 
 
200 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  36.1 
 
 
220 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  36.1 
 
 
220 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  38.35 
 
 
214 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  36.19 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  36.14 
 
 
206 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  35.15 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  37.97 
 
 
208 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  36.08 
 
 
210 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  37.44 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  37.06 
 
 
206 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  37.06 
 
 
206 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  36 
 
 
210 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  34 
 
 
199 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  42.19 
 
 
190 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  36.92 
 
 
205 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  35.38 
 
 
216 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  32.11 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  36.54 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  39.38 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  38.19 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  33.16 
 
 
189 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  34.04 
 
 
189 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  31.55 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  34.48 
 
 
189 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
199 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  31.22 
 
 
186 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1974  intracellular septation protein A  30.48 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  29.52 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  29.32 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  30 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  30 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  30 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  30 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1698  intracellular septation protein A  29.41 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  35.52 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  30.69 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0875  intracellular septation protein A  30.6 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.794525  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  29.95 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  30 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  30.93 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  33.33 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  27.23 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  30.39 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  29.35 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  27.75 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6169  intracellular septation protein A  32.28 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  32.28 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  28.65 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1933  intracellular septation protein A  32.28 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  32.43 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  30 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  32.34 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1878  intracellular septation protein A  35.29 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  32.54 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  30.27 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  28.88 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  30.27 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  30.27 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5211  intracellular septation protein A  32.28 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.18607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1898  intracellular septation protein A  32.28 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1828  intracellular septation protein A  32.28 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332077  normal  0.800874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  29.69 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  29.95 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  28.27 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  32.45 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1364  intracellular septation protein A  35.11 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  31.36 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  29.63 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  33.33 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  29.63 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  29.63 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  34.12 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  27.57 
 
 
186 aa  72  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3397  intracellular septation protein A  29.47 
 
 
178 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000148944  normal  0.569394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  34.12 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  28.12 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  33.53 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>