156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0211 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  80 
 
 
205 aa  330  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  78.17 
 
 
200 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  76.65 
 
 
200 aa  316  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  79.5 
 
 
210 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  81.5 
 
 
205 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  77.55 
 
 
199 aa  291  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  50.5 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  52.63 
 
 
220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  52.97 
 
 
206 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  52.97 
 
 
206 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  48.51 
 
 
214 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  48.04 
 
 
214 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  54.5 
 
 
204 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  50.52 
 
 
210 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  53.72 
 
 
206 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  53.55 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  54.1 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  50.99 
 
 
220 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  50.99 
 
 
220 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  44.95 
 
 
218 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  44.04 
 
 
211 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  44.5 
 
 
233 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  48.29 
 
 
216 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  47.83 
 
 
195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  48.37 
 
 
190 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
208 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  41.75 
 
 
221 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  43.75 
 
 
222 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  36.59 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  39.9 
 
 
209 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  40.72 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  32.54 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  38.34 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  38.34 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  36.14 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  40.24 
 
 
180 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  40.24 
 
 
180 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
188 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  40.24 
 
 
180 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  36.99 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  37.71 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  37.93 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  37.91 
 
 
188 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  37.14 
 
 
181 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
203 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
203 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  33.5 
 
 
222 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  32.63 
 
 
214 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  33.7 
 
 
186 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  32.43 
 
 
179 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  38.55 
 
 
179 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
182 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  34.13 
 
 
215 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
183 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  31.58 
 
 
191 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  39.76 
 
 
179 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  32.24 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  34.76 
 
 
190 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  34.76 
 
 
190 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  39.16 
 
 
179 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  39.16 
 
 
179 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  33.52 
 
 
187 aa  98.2  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4859  intracellular septation protein A  30.58 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.254095  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  35.06 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  31.58 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  32.04 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  37.91 
 
 
186 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  36.36 
 
 
181 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  34.94 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  35.71 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  33.7 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  30.99 
 
 
181 aa  95.1  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  33.68 
 
 
194 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  30.85 
 
 
219 aa  94.4  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  35.1 
 
 
183 aa  94.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  32.8 
 
 
189 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1898  intracellular septation protein A  34.5 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1828  intracellular septation protein A  34.5 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332077  normal  0.800874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1255  intracellular septation protein A  33.7 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  34.5 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>