156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0403 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  89.95 
 
 
200 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  82.91 
 
 
200 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  78.17 
 
 
205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  78.46 
 
 
210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  77.55 
 
 
206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  80.71 
 
 
205 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  52.28 
 
 
220 aa  197  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  49.02 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  53.47 
 
 
204 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  46.67 
 
 
214 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  47.45 
 
 
210 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  51.06 
 
 
206 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  46.15 
 
 
214 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  50.24 
 
 
220 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  50.24 
 
 
220 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  52.41 
 
 
203 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  48.28 
 
 
206 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  48.28 
 
 
206 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  52.08 
 
 
203 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  45.88 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  43.27 
 
 
218 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  48.92 
 
 
195 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  48.02 
 
 
216 aa  167  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  43.13 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  42.49 
 
 
208 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  47.87 
 
 
190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  44.93 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  36.27 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  40.21 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  35.32 
 
 
209 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  33.97 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  37.43 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  37.56 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  37.56 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  37.57 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  38.73 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
203 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
203 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
203 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  36.61 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  39.07 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  40.88 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  38.1 
 
 
190 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  38.1 
 
 
190 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  42.14 
 
 
179 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  42.14 
 
 
179 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  42.14 
 
 
179 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  42.14 
 
 
179 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  42.14 
 
 
179 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  34 
 
 
229 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  34.57 
 
 
214 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  39.62 
 
 
180 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  39.62 
 
 
180 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  39.62 
 
 
180 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  41.51 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
181 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  37.09 
 
 
183 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  36.16 
 
 
181 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  36.26 
 
 
188 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  36.67 
 
 
182 aa  101  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  35.5 
 
 
219 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  35.1 
 
 
182 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  37.75 
 
 
181 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  34.5 
 
 
181 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  38.55 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  36.13 
 
 
181 aa  99.8  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  39.56 
 
 
186 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  37.58 
 
 
179 aa  98.6  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  32.24 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  33.92 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  38.99 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  33.17 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1898  intracellular septation protein A  36.99 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1828  intracellular septation protein A  36.99 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332077  normal  0.800874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  37.43 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  37.91 
 
 
186 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5211  intracellular septation protein A  36.99 
 
 
176 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.18607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1025  intracellular septation protein A  39.33 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  33.95 
 
 
179 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0875  intracellular septation protein A  35.53 
 
 
153 aa  95.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.794525  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  32.96 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6169  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
176 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
176 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1933  intracellular septation protein A  36.42 
 
 
176 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  33.87 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>