156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3090 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  75.98 
 
 		 220 aa  320  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  73.66 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  71.5 
 
 		 214 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  69.52 
 
 		 214 aa  297  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  74.63 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  74.63 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  71.94 
 
 		 216 aa  261  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  60.3 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  58 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  58.33 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  55.07 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  56.86 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  56.86 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  51.02 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  47.34 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  53.11 
 
 		 195 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  52.97 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  52.04 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  48.98 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  47.96 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  50.52 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  45.02 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  47.14 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  48.44 
 
 		 190 aa  171  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  47.45 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  49.26 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  43.46 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  37.97 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  39.71 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  34.12 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  37.88 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  35.61 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  31.9 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  35.86 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  35.86 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4859  intracellular septation protein A  32.92 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.254095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  35.29 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  32.51 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  37.63 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  34.03 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  34.15 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  36.5 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  36.36 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  32.22 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  34.72 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  30.3 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  32.64 
 
 		 180 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  32.64 
 
 		 180 aa  91.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  32.64 
 
 		 180 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  32.31 
 
 		 179 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2018  Intracellular septation protein A  31.03 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  35.56 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  31.77 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  34.76 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  33.51 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  32.47 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  31.67 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 181 aa  88.2  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  35.71 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2937  intracellular septation protein A  32.82 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  37.89 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  31.94 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  31.94 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  37.89 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  29.57 
 
 		 181 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  34.19 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  32.48 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  32.7 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1766  intracellular septation protein A  29.95 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  29.17 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  35.29 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  31.09 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1878  intracellular septation protein A  38.28 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  34.22 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  31.18 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3397  intracellular septation protein A  30.73 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000148944  normal  0.569394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  31.94 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  33.33 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2903  intracellular septation protein A  33 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130707  normal  0.228899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2278  intracellular septation protein A  32.29 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1025  intracellular septation protein A  35.26 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  31.82 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>