154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2723 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  57.69 
 
 
211 aa  250  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  58.42 
 
 
208 aa  244  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  55.05 
 
 
200 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  52.76 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  52.76 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  49.76 
 
 
229 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  38.92 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  36.95 
 
 
200 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  36.32 
 
 
218 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  37.68 
 
 
205 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  39.9 
 
 
206 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  35.59 
 
 
233 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  35.75 
 
 
220 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  34.27 
 
 
220 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  37.13 
 
 
195 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  36.82 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  32.21 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  34.93 
 
 
220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  34.93 
 
 
220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  35.32 
 
 
199 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  35.41 
 
 
204 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  37.89 
 
 
205 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  38.31 
 
 
203 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  33.01 
 
 
208 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  30.65 
 
 
211 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  36.87 
 
 
190 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  34.01 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  33.5 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  33.5 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  33.5 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  38.07 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  32.06 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  31.69 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  31.43 
 
 
216 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  27.88 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  30.1 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  30.46 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  31.74 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  31.74 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  31.74 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  31.74 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  35.12 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  27.23 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  31.14 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  29.89 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  30.54 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  31.74 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  30.54 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  30.54 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  30.54 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  31.43 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  29.94 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  29.53 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  30.54 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1698  intracellular septation protein A  31.5 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  30.54 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4859  intracellular septation protein A  26.39 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.254095  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1974  intracellular septation protein A  31.5 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1026  intracellular septation protein A  28.48 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0746362  normal  0.702074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  31.14 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  28.12 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  29.19 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  29.8 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  31.21 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  28.27 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  29.93 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  30.13 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  26.23 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1878  intracellular septation protein A  32.09 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  31.58 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  31.64 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  29.63 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  31.64 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  29.63 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  28.93 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  29.35 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  28.74 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  32.14 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1809  intracellular septation protein A  29.59 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  27.78 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  23.63 
 
 
181 aa  61.6  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3587  intracellular septation protein A  29.74 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92433  normal  0.454348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3790  intracellular septation protein A  29.95 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000185516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  30 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  26.58 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  29.35 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  29.35 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  29.35 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  29.35 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2029  intracellular septation protein A  30.47 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1675  intracellular septation protein A  30.47 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  28.19 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  23.08 
 
 
181 aa  58.9  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  27.75 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4501  intracellular septation protein A  28.34 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211364  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1411  intracellular septation protein A  28.34 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0302697  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4007  intracellular septation protein A  28.34 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2111  intracellular septation protein A  30 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00323597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  28.8 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>