156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2655 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  100 
 
 
190 aa  367  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  51.01 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  51.34 
 
 
220 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  49.23 
 
 
214 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  52.41 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  52.41 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  45.92 
 
 
211 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  48.21 
 
 
214 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  56.67 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  51.67 
 
 
206 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  51.67 
 
 
206 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  52.22 
 
 
206 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  48.44 
 
 
210 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  48.91 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  49.46 
 
 
205 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  48.39 
 
 
200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  48.66 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  54.64 
 
 
203 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  50 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  48.13 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  48.37 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  49.72 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  42.13 
 
 
233 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  48.39 
 
 
210 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  47.87 
 
 
199 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  41.43 
 
 
218 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  49.46 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  39.9 
 
 
221 aa  141  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  38.29 
 
 
222 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  36.27 
 
 
219 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  36.87 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  41.36 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  42.19 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  36.87 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  40.53 
 
 
200 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  40.53 
 
 
200 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  35.26 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  35.56 
 
 
181 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  38.95 
 
 
189 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4859  intracellular septation protein A  35.91 
 
 
221 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.254095  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  35.52 
 
 
188 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  36.05 
 
 
191 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  36.22 
 
 
181 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  34.92 
 
 
222 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  36.93 
 
 
181 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  32.86 
 
 
215 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  37.06 
 
 
181 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  32.43 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  35.88 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  35.88 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  33.86 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  33.86 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  34.41 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  33.15 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  34.41 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  34.41 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  34.05 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  33.13 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  35.45 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  35.45 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  35.09 
 
 
188 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  32.97 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  34.09 
 
 
181 aa  94.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  35.8 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  34.5 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  35.23 
 
 
179 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  37.43 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  34.09 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  34.09 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  34.09 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  34.12 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  33.52 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  34.66 
 
 
179 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  37.36 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  33.52 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1025  intracellular septation protein A  37.8 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  34.66 
 
 
179 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  34.66 
 
 
179 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  34.66 
 
 
179 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  33.53 
 
 
203 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  33.53 
 
 
203 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  32.61 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  35.87 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3397  intracellular septation protein A  39.31 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000148944  normal  0.569394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  32.75 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  31.58 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  32.63 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  34.66 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  30.99 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1922  intracellular septation protein A  37.8 
 
 
176 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  0.794115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>