156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0518 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0518  intracellular septation protein A  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0363  intracellular septation protein A  90.69 
 
 		 205 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0317  intracellular septation protein A  79.08 
 
 		 200 aa  320  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0376  intracellular septation protein A  79.59 
 
 		 200 aa  320  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0206  intracellular septation protein A  88.24 
 
 		 205 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0211  intracellular septation protein A  79.5 
 
 		 206 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0268679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0403  intracellular septation protein A  78.46 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0924  intracellular septation protein A  51.22 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3745  intracellular septation protein A  48.31 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.826978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3090  intracellular septation protein A  52.04 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.779828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4068  intracellular septation protein A  48.29 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4410  intracellular septation protein A  53.69 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5339  intracellular septation protein A  54.08 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3388  intracellular septation protein A  48.33 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.555044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3411  intracellular septation protein A  55.15 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2846  intracellular septation protein A  56.08 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2724  intracellular septation protein A  56.08 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2951  intracellular septation protein A  56.08 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  hitchhiker  0.00325038 
 
 
-
 
NC_004310  BR1935  intracellular septation protein A  48.2 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1862  intracellular septation protein A  48.2 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4195  intracellular septation protein A  50.45 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0095  intracellular septation protein A  44.29 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.695813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1412  intracellular septation protein A  44.33 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2931  intracellular septation protein A  43.35 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3143  Intracellular septation protein A  43.72 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0207  intracellular septation protein A  47.59 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0315128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2655  intracellular septation protein A  48.42 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0016  intracellular septation protein A  39.8 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0792337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1940  intracellular septation protein A  35.82 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.566352  normal  0.148621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3506  intracellular septation protein A  37.85 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2723  intracellular septation protein A  36.82 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0630  intracellular septation protein A  42.55 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  41.29 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1216  intracellular septation protein A  32.35 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  37.87 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1841  intracellular septation protein  39.36 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0490  intracellular septation protein A  39.36 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0165388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  36.61 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4299  intracellular septation protein A  36.08 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  42.38 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2733  intracellular septation protein A  33.66 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.126385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  37.42 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  37.42 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  37.42 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  37.42 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  41.51 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  41.51 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  41.51 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  41.51 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  39.62 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  39.62 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  39.62 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  36.77 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  35.67 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  38.99 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  38.41 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  36.16 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  38 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  40.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  32.43 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  36.42 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  37.91 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1399  intracellular septation protein A  33.85 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  34.66 
 
 		 187 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  37.09 
 
 		 181 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  37.09 
 
 		 181 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  34.5 
 
 		 181 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  37.09 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  37.09 
 
 		 181 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  34.44 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  38.36 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  36.77 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1986  intracellular septation protein A  30.56 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  32.97 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  35.76 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  33.92 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  37.11 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1933  intracellular septation protein A  37.57 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  32.62 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6169  intracellular septation protein A  37.57 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  37.57 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1898  intracellular septation protein A  37.57 
 
 		 176 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1828  intracellular septation protein A  37.57 
 
 		 176 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332077  normal  0.800874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  35.36 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  33.69 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0875  intracellular septation protein A  35.53 
 
 		 153 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.794525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5211  intracellular septation protein A  37.57 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.18607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2855  intracellular septation protein  33.85 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.844901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  33.89 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  33.86 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  35.64 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>