105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1760 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1760  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1151  hypothetical protein  65.93 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0591  hypothetical protein  61.19 
 
 		 135 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0336  hypothetical protein  61.94 
 
 		 135 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1940  hypothetical protein  61.19 
 
 		 135 aa  169  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1771  hypothetical protein  63.91 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  56.91 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  48.68 
 
 		 185 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  47.95 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  47.37 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  47.37 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  47.37 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  43.02 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  47.37 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  47.37 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  45.78 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  33.82 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  45 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  42.68 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  46.75 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  44.74 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  44.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  46.05 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  44.74 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  42.47 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  37.66 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3273  hypothetical protein  38.54 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  43.42 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  36.56 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  43.48 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  45.21 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  53.57 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  43.42 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  42.11 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  42.11 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  49.09 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  39.47 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  43.9 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  40.59 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  42.11 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  41.77 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0344  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  36.54 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  32.03 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  40.79 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  40.79 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1265  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.229462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  40.28 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  38.16 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  36.56 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  37.97 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  39.47 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  42.19 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  40.54 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  46.27 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  40.79 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5828  hypothetical protein  35.8 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  36.56 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  40.58 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  44.62 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  40.79 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  47.37 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  39.19 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  34.44 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  36.59 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  37.84 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  38.78 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  38.96 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  41.79 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  36.14 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  36.14 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  40.62 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  36.14 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  32.98 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  36.14 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1395  hypothetical protein  39.73 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  33.8 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  36.49 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  44.23 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  39.34 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4394  hypothetical protein  48.89 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  0.0572179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  35.59 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  37.68 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4334  hypothetical protein  50.91 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>