107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2228 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2688  hypothetical protein  95.03 
 
 		 182 aa  347  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2424  hypothetical protein  86.74 
 
 		 194 aa  314  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2695  hypothetical protein  58.7 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2815  hypothetical protein  59.24 
 
 		 191 aa  200  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0820  hypothetical protein  56.91 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0971  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1863  hypothetical protein  58.52 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2474  hypothetical protein  58.52 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2523  hypothetical protein  57.22 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2234  hypothetical protein  56.65 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2479  hypothetical protein  58.38 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5805  hypothetical protein  56.11 
 
 		 180 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0376383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2391  hypothetical protein  57.8 
 
 		 182 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0815  hypothetical protein  57.89 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3663  hypothetical protein  57.8 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0664  hypothetical protein  56.14 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1167  hypothetical protein  56.14 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2347  hypothetical protein  56.14 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2938  hypothetical protein  56.14 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1014  hypothetical protein  56.14 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1661  hypothetical protein  56.14 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1007  hypothetical protein  55.56 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3458  hypothetical protein  51.45 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40780  hypothetical protein  50.29 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2514  hypothetical protein  48.28 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2729  hypothetical protein  49.71 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1977  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2370  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.741209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3325  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1883  hypothetical protein  49.43 
 
 		 164 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2461  hypothetical protein  47.98 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248584  hitchhiker  0.00666738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3113  hypothetical protein  47.98 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10560  hypothetical protein  48.85 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0963  hypothetical protein  62.93 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27530  hypothetical protein  46.02 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3155  hypothetical protein  42.37 
 
 		 165 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2146  hypothetical protein  46.82 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0124089  normal  0.436293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0797  hypothetical protein  46.29 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1529  hypothetical protein  45 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00088632  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1672  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.162015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2913  hypothetical protein  44 
 
 		 169 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1892  hypothetical protein  45.68 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2014  hypothetical protein  36.42 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.320985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0888  hypothetical protein  45.77 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3266  hypothetical protein  43.48 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0344  hypothetical protein  41.41 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2060  hypothetical protein  38.32 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2346  hypothetical protein  35.17 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992111  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1502  hypothetical protein  37.8 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.08598  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1863  hypothetical protein  39.26 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2785  hypothetical protein  37.88 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0769  hypothetical protein  43.33 
 
 		 148 aa  85.1  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1639  hypothetical protein  49.02 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32179  normal  0.281351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2407  hypothetical protein  43.4 
 
 		 131 aa  84.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1396  hypothetical protein  42.15 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2559  hypothetical protein  45.28 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.685831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4653  hypothetical protein  46.6 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00156342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1102  hypothetical protein  44.95 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2457  hypothetical protein  45.05 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1826  hypothetical protein  48.08 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248262  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1930  hypothetical protein  44.66 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3054  hypothetical protein  43.24 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365359  normal  0.266597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6979  hypothetical protein  42.11 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2149  hypothetical protein  42.48 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2338  hypothetical protein  42.24 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2428  hypothetical protein  43.1 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5828  hypothetical protein  41.82 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4057  hypothetical protein  59.42 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3123  hypothetical protein  41.41 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1794  hypothetical protein  46.67 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1928  hypothetical protein  46.67 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.320928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1382  hypothetical protein  36.97 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0183  hypothetical protein  42.11 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0192  hypothetical protein  44.55 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4514  hypothetical protein  40.37 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1402  hypothetical protein  47.5 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2263  hypothetical protein  35.16 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3993  hypothetical protein  42.59 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3930  hypothetical protein  48.05 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0177  hypothetical protein  41.23 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0921  hypothetical protein  41.24 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3273  hypothetical protein  45.33 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4012  hypothetical protein  45.88 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4693  hypothetical protein  34.42 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1109  hypothetical protein  39.36 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5806  hypothetical protein  37.04 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3053  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.728603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1567  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1240  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0629  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1434  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1465  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1353  hypothetical protein  61.7 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975358  normal  0.124048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1771  hypothetical protein  41.75 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1265  hypothetical protein  40.59 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.229462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4394  hypothetical protein  59.18 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  0.0572179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1760  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0657  hypothetical protein  41.98 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1067  hypothetical protein  29.91 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>